Rukovodstvo Instituta čine:
- Direktor Instituta
- Tehnički direktor
- Pomoćnik direktora za kvalitet
- Pomoćnik direktora za nauku
- Pomoćnik direktora za opšte, finansijske i pravne poslove
- Upravnik zavoda za zdravstvenu zaštitu – Tehnički rukovodilac laboratorija
- Upravnik zavoda za kontrolu hrane i lekova – Tehnički rukovodilac laboratorija
- Rukovodilac Centra za tretman infektivnog, veterinarskog i medicinskog otpada
Direktor
Dr sci.vet.med. Dobrila Jakić Dimić, naučni savetnik
Tehnički direktor
Dr sci.vet.med. Slobodan Stanojević, naučni saradnik
Pomoćnik direktora za kvalitet
Marko Bevenja, dipl. pravnik
Pomoćnik direktora za nauku
Dr sci.vet.med. Vladimir Radosavljević, naučni savetnik
Pomoćnik direktora za opšte, finansijske i pravne poslove
Dejan Tmušić, dipl. ecc.
Upravnik zavoda za zdravstvenu zaštitu – Tehnički rukovodilac laboratorija
Dr sci.vet.med. Jadranka Žutić, naučni savetnik
Upravnik zavoda za kontrolu hrane i lekova – Tehnički rukovodilac laboratorija
Dr sci.vet.med. Jasna Kureljušić, viši naučni saradnik
Rukovodilac Centra za tretman infektivnog, veterinarskog i medicinskog otpada
Dr sci.vet.med. Slobodan Stanojević, naučni saradnik