Један од циљева Института као научноистраживачке организације је успостављање међународне научне сарадње ради брже интеграције у светске научне, привредне, друштвене и културне токове и укључивање у европски истраживачки простор. Постоји изражена потреба Института за јачањем свих облика међународне сарадње у области биомедицинских и биотехничких наука, што укључује пре свега:
– размену/мобилност истраживача Института
– развијање нових метода научноистраживачког рада
– пријаву заједничких међународних пројеката
– публиковање научних радова
– организацију научних конференција
Истраживачи Института имају интензивну сарадњу са бројним истакнутим научницима и институцијама у свету. У оквиру тога, политика Института је да формира заједничке истраживачке пројекте у оквиру чега подстиче боравак и размену својих истраживача у светски признатим лабораторијама ради стицања искуства у међународним оквирима. Посебно добра формална или неформална сарадња постоји са низом институција, укључујући и:
- Institute of Quality Standards and Testing Technology for Agro-products of Chinese Academy of Agricultural Sciences
- The Friedrich-Loeffler-Institut (FLI) Insel Riems
- The World Organisation for Animal Health (WOAH)
- International Centre for Veterinary Training and Information „Francesco Gramenzi“ (CIFIV), Istituto „Caporale„, Teramo
- The Technical University of Denmark (DTU)
- EuFMD, The Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO)
- Iowa State University, College of Veterinary Medicine, Ames, SAD
- The Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell’Abruzzo e del Molise “Giuseppe Caporale” (IZSAM), Терамо, Италија
- Institute for Fisheries Research – Lyngby, Данска
- The Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science, CEFAS – Weymouth, Велика Британија
- National Institute for Public Health and the Environment, Холандија
- Department of Clinical Veterinary Medicine University of Cambridge, Велика Британија
- National Veterinary Institute – Осло, Норвешка
- Faculty of Veterinary Medicine – Иаси, Румунија
- Faculty of Veterinary Medicine – Тимисоара, Румунија
- Faculty of Veterinary Medicine – Цлуј-Напоца, Румунија
- Univeristy of Veterinary Medicine, Беч, Аустрија
- Ветеринарски факултет – Сарајево, Босна и Херцеговина
- Хрватски ветеринарски институт – Загреб, Хрватска
- Ветеринарски факултет – Солун, Грчка
- Ветеринарски институт Васо Бутозан – Бања Лука, Босна и Херцеговина
- Ветеринарски институт у Скопју, Македонија
- Факултет ветеринарске медицине – Скопје, Македонија
- Carlo Denegri Fondation & Infectious Disease, Unit A, Tropical and Parasitology Service Amedeo di Savoia Hospital, Торино, Италија
- Institute for Comparative Tropical Medicine and Parasitology, Ludwig-Maximilians University (LMU), Минхен, Немачка
- Veterinary Research Institute of Thessaloniki NAGREF – Солун, Грчка
- Labooratoria de Parasitologie CHU Purpan – Тулуз, Француска
- National Diagnostic Scientific Veterinary Institute – Софија, Бугарска
Институт је један од оснивача Међународног центра – Centre for Veterinary Training and Information “Francesco Gramenzi” (CIFIV), Терамо, Италија.