Jedan od ciljeva Instituta kao naučnoistraživačke organizacije je uspostavljanje međunarodne naučne saradnje radi brže integracije u svetske naučne, privredne, društvene i kulturne tokove i uključivanje u evropski istraživački prostor. Postoji izražena potreba Instituta za jačanjem svih oblika međunarodne saradnje u oblasti biomedicinskih i biotehničkih nauka, što uključuje pre svega:
– razmenu/mobilnost istraživača Instituta
– razvijanje novih metoda naučnoistraživačkog rada
– prijavu zajedničkih međunarodnih projekata
– publikovanje naučnih radova
– organizaciju naučnih konferencija
Istraživači Instituta imaju intenzivnu saradnju sa brojnim istaknutim naučnicima i institucijama u svetu. U okviru toga, politika Instituta je da formira zajedničke istraživačke projekte u okviru čega podstiče boravak i razmenu svojih istraživača u svetski priznatim laboratorijama radi sticanja iskustva u međunarodnim okvirima. Posebno dobra formalna ili neformalna saradnja postoji sa nizom institucija, uključujući i:
- Institute of Quality Standards and Testing Technology for Agro-products of Chinese Academy of Agricultural Sciences
- The Friedrich-Loeffler-Institut (FLI) Insel Riems
- The World Organisation for Animal Health (WOAH)
- International Centre for Veterinary Training and Information „Francesco Gramenzi“ (CIFIV), Istituto „Caporale„, Teramo
- The Technical University of Denmark (DTU)
- EuFMD, The Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO)
- Iowa State University, College of Veterinary Medicine, Ames, SAD
- The Istituto Zooprofilattico Sperimentale dell’Abruzzo e del Molise “Giuseppe Caporale” (IZSAM), Teramo, Italija
- Institute for Fisheries Research – Lyngby, Danska
- The Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science, CEFAS – Weymouth, Velika Britanija
- National Institute for Public Health and the Environment, Holandija
- Department of Clinical Veterinary Medicine University of Cambridge, Velika Britanija
- National Veterinary Institute – Oslo, Norveška
- Faculty of Veterinary Medicine – Iasi, Rumunija
- Faculty of Veterinary Medicine – Timisoara, Rumunija
- Faculty of Veterinary Medicine – Cluj-Napoca, Rumunija
- Univeristy of Veterinary Medicine, Beč, Austrija
- Veterinarski fakultet – Sarajevo, Bosna i Hercegovina
- Hrvatski veterinarski institut – Zagreb, Hrvatska
- Veterinarski fakultet – Solun, Grčka
- Veterinarski institut Vaso Butozan – Banja Luka, Bosna i Hercegovina
- Veterinarski institut u Skopju, Makedonija
- Fakultet veterinarske medicine – Skopje, Makedonija
- Carlo Denegri Fondation & Infectious Disease, Unit A, Tropical and Parasitology Service Amedeo di Savoia Hospital, Torino, Italija
- Institute for Comparative Tropical Medicine and Parasitology, Ludwig-Maximilians University (LMU), Minhen, Nemačka
- Veterinary Research Institute of Thessaloniki NAGREF – Solun, Grčka
- Labooratoria de Parasitologie CHU Purpan – Tuluz, Francuska
- National Diagnostic Scientific Veterinary Institute – Sofija, Bugarska
Institut je jedan od osnivača Međunarodnog centra – Centre for Veterinary Training and Information “Francesco Gramenzi” (CIFIV), Teramo, Italija.