Odeljenje formirano 1980/81. godine.
1993. dobija status Vodeće koordinirajuće laboratorije za bolesti riba za SR Jugoslaviju.
2007. godine postaje Nacionalna referentna laboratorija za bolesti riba.
2009. godine Rešenjem Ministarstva za poljoprivredu, šumarstvo i vodoprivredu – Uprava za veterinu, Odeljenje je ovlašćeno za obavljanje laboratorijske dijagnostike bolesti riba u uzorcima patološkog materijala, čuvanje referentnih seruma i standardnih reagenasa i izolata, uvođenje novih dijagnostičkih metoda, testiranje dijagnostičkih reagenasa i organizovanje međulaboratorijskih uporednih testiranja laboratorija na nacionalnom nivou, kao i potvrdna ispitivanja nalaza dobijenih u drugim laboratorijama.
Delatnost Odeljenja obuhvata naučno – istraživački rad i specijalističko – stručni rad.
U Odeljenju se vrše dijagnostička ispitivanja biološkog materijala koji potiče od riba: serološko- imunološka, virusološka, bakteriološka, parazitološka, mikološka i molekularna.
Navedena ispitivanja se vrše standardnim i međunarodno priznatim metodama.
Većina metoda koje se primenjuju akreditovane su prema standardu SRPS ISO/IEC 17025:2006.