Основна делатност Одељења је рад на дијагностици бактеријских и паразитских обољења домаћих и дивљих животиња, укључујући и антропозоонозе (бактеријске и паразитарне).

Научно-истраживачка делатност реализује се учешћем на међународним и националним пројектима и сарадњом са сродним институцијама у земљи и иностранству.

Активност одељења одвија се у две лабораторије: лабораторија за бактериологију и лабораторија за паразитологију.

Лабораторија за бактериологију

• Дијагностика обољења животиња бактеријске етиологије

• Мониторинг осетљивости изолованих бактеријских култура на антимикробна средства

• Истраживање ефикасности и безбедности експерименталних, аутохтоних вакцина намењених имунопрофилакси инфекција респираторног и дигестивног тракта свиња и говеда

• Припрема  дијагностикума за одређена лабораторијска испитивања

• Учешће у изради и примени програма здравствене заштите животиња

• Учешће у научно-истраживачким пројектима и сарадња са другим институцијама у научним и стручним истраживањима

Главне активности:

• Бактериолошке анализе узорака анималног порекла, и то:
• ∙ органа животиња након пост-морталног испитивања
• ∙ брисева (носни, ректални, цервико-вагинални и др.)
• ∙  млека на присуство узрочника маститиса
• ∙ сперме и препуцијалних испирака
• ∙ крви, урина, фецеса, коже, вуне и др.

•  Дијагностика већег броја бактеријских болести:
• пастерелоза
• кампилобактериоза
• актинобацилусна плеуропнеумонија
• колибацилоза
• салмонелоза
• листериоза
• црвени ветар
• стрептококне и стафилококне инфекције
• инфекције узроковане анаеробним бактеријама
• и других значајних бактеријских инфекција животиња

• Идентификација и типизација изолованих бактеријских култура  применом класичних и савремених биохемијских идентификационих система (АПИ, ББЛ Црyстал, Слидеx кит и др.)

• Дијагностика појединих бактеријских болести применом ПЦР

• Испитивање осетљивости изолованих бактеријских култура на антибиотике применом диск-дифузионог метода (антибиограм) и одређивањем минималних инхибиционих концетрација (Е-тест)

• Серолошка типизација бактерија Е. цоли

• Серолошка типизација бактерија салмонела

• Мониторинг присуства узрочника значајних бактеријских зооноза  (Е. цоли О157Х7, Стрептоцоццус суис, МРСА и др.) у клиничким узорцима

Лабораторија за паразитологију

Области рада:

•  Дијагностичка испитивања:
• копролошка дијагностика методама седиментације, флотације и нативних препарата
• култивација узрочника (протозое, хелминти)
• хематолошки прегледи на крвне паразите (бабезије, ерлихије и др.) и филарије
• имунолошка дијагностика Ехрлицхиа цаниси Леисцхманиа спп.
• дерматолошки прегледи на шугу, демодикозу, мијазе и друге ектопаразитске инфекције
• ентомолошка испитивања и детерминација артропода и инсеката
• испитивање зелених површина и земљишта на присуство јаја/ооцисти паразита и крпеље
• идентификација адултних и развојних облика протозоа, артропода и хелмината морфометријом, а парамфистомида хистолошком техником
• паразитолошки преглед меса сисара, птица и риба на присуство паразита (трихинелоза, бобичавост, анисакис, кудо, токсоплазма и др.)
• преглед пчела и пчелињег легла на паразите
• израда програма терапије, сузбијања и ерадикације обољења паразитске етиологије