Од оснивања Института научноистраживачки рад је био једно од основних поља његове делатности. Стручњаци Централног ветеринарског бактериолошког завода су се од његовог оснивања 1926.године бавили и просвећивањем сточара и држали су редовно предавања о сточним заразама на Радио-станици Београд.
У току 1967. године Републичка заједница за научни рад уписала је у регистар научних установа јединицу Завода, а почетком 1971. Републички секретаријат за образовање, науку и културу својим актом бр. 04-022-159 признао је Заводу као целини, статус научне установе. Сходно одредбама Закона о научноистраживачкој делатности, Институт је извршио акредитацију научно-истраживачког рада и заведен је у регистар института као истраживачко развојни институт под редним бројем 110-00-34/58 од 03.12.2007.
Одбор за акредитацију научноистраживачких организација је донео Одлуку бр.640-01-1/48 од 15.5.2012. којом је Институт акредитован као истраживачко-развојни институт – установа у области биотехничких наука – ветеринарство.
У новембру 2015. године је у складу са Правилником о вредновању научноистраживачког рада и поступку акредитације института, интегрисаних универзитета, факултета и центара изузетних вредности („Сл. гласник РС“, бр. 69/2015) покренут поступак акредитације и испуњеност услова за акредитацију НИВС за обављање научноистраживачке делатности од општег интереса. Одбор за акредитацију научноистраживачких организација је 08.03.2016. године донео Одлуку бр. 660-01-00013/28 којом је Институт реакредитован као истраживачко-развојни институт – установа у области биотехничких наука – ветеринарство.
За питања од значаја за научноистраживачки рад у Институту се образује Научно веће Института. Научно веће је стручни орган Института које сачињавају доктори наука у научним или наставним звањима који су у радном односу са пуним радним временом у Институту. Истраживачи Института су континуирано од 1946. до данас руководили и учествовали у међународним пројектима и у више од 60 пројеката основних, технолошких, развојних и националних истраживања расписаних од стране Министарства просвете, науке и технолошког развоја Републике Србије.
Као резултат наведених пројеката остварен је развој и увођење нових и модификованих метода дијагностике заразних и паразитских болести, детекција и примоизолација инфективних агенаса, израда мера ерадикације, превентиве и сузбијања болести животиња, расветљавање мултикаузалних неонаталних обољења животиња у фармском узгоју, развој вакцина, израда мера здравствене контроле и др. Кроз наведене пројекте остварени су значајни резултати који су публиковани у преко 50 монографија и поглавља у монографијама, 3 атласа, 6 уџбеника, 32 приручника и брошура, 14 агитки и више наставних филмова. У истом периоду је реферисано више од 4000 радова на међународним и националним саветовањима и преко 500 радова је публиковано у међународним и националним часописима. У оквиру ових пројеката је одбрањен већи број доктората, магистеријума и специјализација.
Библиотека Института је регистрована библиотека у оквиру библиотечког система Универзитетске библиотеке “Светозар Марковић“ (бр. 06-218/206 од 24.11.1997). Поседује фонд од више стотина књига и часописа, као и електронске часописе са ЕБСЦО базе података. Обраде фонда библиотеке се врши у програму БИБЛИО Wин ИСИС који у подржава ИСО стандарде прописане од ИФЛА.